MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 27916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013203	ATG	2	6	264428	264433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784034
4502	NC_013203	GGC	2	6	264474	264479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784034
4503	NC_013203	AGGT	2	8	264539	264546	25 %	25 %	50 %	0 %	257784034
4504	NC_013203	AGG	2	6	264557	264562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784034
4505	NC_013203	TGC	2	6	264567	264572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784034
4506	NC_013203	GCG	2	6	264580	264585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784034
4507	NC_013203	GAG	2	6	264634	264639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784034
4508	NC_013203	ACG	2	6	264656	264661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784034
4509	NC_013203	TGA	2	6	264719	264724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784034
4510	NC_013203	GCT	2	6	264856	264861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784034
4511	NC_013203	GA	3	6	264894	264899	50 %	0 %	50 %	0 %	257784034
4512	NC_013203	GTT	2	6	264916	264921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784034
4513	NC_013203	CTG	2	6	264932	264937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784034
4514	NC_013203	TCT	2	6	265011	265016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784034
4515	NC_013203	TAG	2	6	265020	265025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784034
4516	NC_013203	CAT	2	6	265068	265073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784034
4517	NC_013203	TTG	2	6	265109	265114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784034
4518	NC_013203	GTT	2	6	265150	265155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784034
4519	NC_013203	ACG	2	6	265225	265230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784034
4520	NC_013203	GGC	3	9	265279	265287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784034
4521	NC_013203	ACGC	2	8	265438	265445	25 %	0 %	25 %	50 %	257784035
4522	NC_013203	TGA	2	6	265526	265531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
4523	NC_013203	CTG	2	6	265559	265564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784035
4524	NC_013203	TGA	3	9	265605	265613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
4525	NC_013203	TAC	2	6	265677	265682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784035
4526	NC_013203	TGC	2	6	265685	265690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784035
4527	NC_013203	ACGTT	2	10	265694	265703	20 %	40 %	20 %	20 %	257784035
4528	NC_013203	TAC	2	6	265789	265794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784035
4529	NC_013203	GGT	2	6	265819	265824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784035
4530	NC_013203	CGG	2	6	265868	265873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784035
4531	NC_013203	TGA	2	6	265884	265889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
4532	NC_013203	AGT	2	6	266016	266021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784035
4533	NC_013203	GCTT	2	8	266039	266046	0 %	50 %	25 %	25 %	257784035
4534	NC_013203	AGG	2	6	266154	266159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784035
4535	NC_013203	TCT	2	6	266231	266236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784036
4536	NC_013203	TTA	2	6	266272	266277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784036
4537	NC_013203	ATTG	2	8	266288	266295	25 %	50 %	25 %	0 %	257784036
4538	NC_013203	ACA	2	6	266384	266389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784036
4539	NC_013203	TCAGC	2	10	266464	266473	20 %	20 %	20 %	40 %	257784036
4540	NC_013203	CG	3	6	266489	266494	0 %	0 %	50 %	50 %	257784036
4541	NC_013203	ATC	2	6	266496	266501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784036
4542	NC_013203	TTACT	2	10	266516	266525	20 %	60 %	0 %	20 %	257784036
4543	NC_013203	TTC	2	6	266596	266601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784036
4544	NC_013203	GTT	2	6	266658	266663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784036
4545	NC_013203	GGT	2	6	266706	266711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784036
4546	NC_013203	TGG	2	6	266720	266725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784036
4547	NC_013203	GCT	2	6	266738	266743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784036
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4549	NC_013203	TTGG	2	8	267009	267016	0 %	50 %	50 %	0 %	257784036
4550	NC_013203	ATG	2	6	267036	267041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784036
4551	NC_013203	CG	3	6	267099	267104	0 %	0 %	50 %	50 %	257784036
4552	NC_013203	GTG	2	6	267157	267162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784036
4553	NC_013203	TGGC	2	8	267202	267209	0 %	25 %	50 %	25 %	257784036
4554	NC_013203	GAT	2	6	267221	267226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784036
4555	NC_013203	ATT	2	6	267252	267257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784036
4556	NC_013203	GCATTG	2	12	267292	267303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257784036
4557	NC_013203	GATT	2	8	267304	267311	25 %	50 %	25 %	0 %	257784036
4558	NC_013203	TCG	2	6	267329	267334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784036
4559	NC_013203	CTT	2	6	267411	267416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784037
4560	NC_013203	GAT	2	6	267417	267422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784037
4561	NC_013203	CAT	2	6	267519	267524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784037
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4563	NC_013203	ACT	2	6	267583	267588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784037
4564	NC_013203	TAA	2	6	267612	267617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784037
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4567	NC_013203	TCA	2	6	267850	267855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784037
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4569	NC_013203	AG	3	6	267924	267929	50 %	0 %	50 %	0 %	257784037
4570	NC_013203	TTG	2	6	267970	267975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784037
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4572	NC_013203	CCTG	2	8	268020	268027	0 %	25 %	25 %	50 %	257784037
4573	NC_013203	TTC	2	6	268215	268220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784037
4574	NC_013203	TTCT	2	8	268238	268245	0 %	75 %	0 %	25 %	257784037
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4579	NC_013203	TCA	2	6	268643	268648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784038
4580	NC_013203	TAT	2	6	268682	268687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784038
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4585	NC_013203	ATT	2	6	268878	268883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784038
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4588	NC_013203	TGC	2	6	268949	268954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784038
4589	NC_013203	GGTGC	2	10	268956	268965	0 %	20 %	60 %	20 %	257784038
4590	NC_013203	GTCTT	2	10	268981	268990	0 %	60 %	20 %	20 %	257784038
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4596	NC_013203	CGGTAT	2	12	269311	269322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257784039
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4601	NC_013203	ACCC	2	8	269587	269594	25 %	0 %	0 %	75 %	257784039
4602	NC_013203	TGA	2	6	269618	269623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784039
4603	NC_013203	CTGCA	2	10	269651	269660	20 %	20 %	20 %	40 %	257784039
4604	NC_013203	GTT	2	6	269795	269800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784039
4605	NC_013203	CCAAC	2	10	269835	269844	40 %	0 %	0 %	60 %	257784039
4606	NC_013203	CGC	2	6	269866	269871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784039
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4608	NC_013203	C	6	6	269987	269992	0 %	0 %	0 %	100 %	257784039
4609	NC_013203	CAG	2	6	270020	270025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784039
4610	NC_013203	TA	3	6	270034	270039	50 %	50 %	0 %	0 %	257784039
4611	NC_013203	GCCATC	2	12	270071	270082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257784039
4612	NC_013203	G	6	6	270123	270128	0 %	0 %	100 %	0 %	257784039
4613	NC_013203	ATG	2	6	270145	270150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784039
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4621	NC_013203	GTT	2	6	270368	270373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784039
4622	NC_013203	ATGGG	2	10	270642	270651	20 %	20 %	60 %	0 %	257784040
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4858	NC_013203	CGA	2	6	283199	283204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784046
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4983	NC_013203	ATT	2	6	290717	290722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784054
4984	NC_013203	AT	3	6	290766	290771	50 %	50 %	0 %	0 %	257784055
4985	NC_013203	TGC	2	6	290780	290785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784055
4986	NC_013203	TGT	2	6	290810	290815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784055
4987	NC_013203	TGC	2	6	290885	290890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784055
4988	NC_013203	TGT	2	6	290926	290931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784055
4989	NC_013203	CGTGT	2	10	290952	290961	0 %	40 %	40 %	20 %	257784055
4990	NC_013203	GTA	2	6	291186	291191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784055
4991	NC_013203	ATGT	2	8	291217	291224	25 %	50 %	25 %	0 %	257784055
4992	NC_013203	TTG	2	6	291274	291279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784055
4993	NC_013203	TGA	2	6	291317	291322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784055
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4999	NC_013203	CTC	2	6	291808	291813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784055
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